Conducerea executivă a Universităţii de Medicină şi Farmacie din Craiova este asigurată de Rector, asistat de patru prorectori, un director general administrativ şi de secretariat. Forul suprem de decizie este Senatul Universităţii, format din 40 persoane.
Rector:
Prof. univ. dr. Dan-Ionuț Gheonea
Prorector cu managementul academic:
Prof. univ. dr. Cristian Gheonea
Prorector cu activitățile studenţilor:
Prof. univ. dr. Johny Neamtu
Prorector cu învăţământul postuniversitar și rezidenţiat:
Prof. univ. dr. Florin Anghelina
Prorector cu relații internaționale si parteneriate academice:
Prof. univ. dr. Florin Burada